エコシステムは、生物や環境要素が相互に関わり合いながら成り立つまとまりを指す。ここでは、単に非人間世界の自然環境を意味するだけでなく、物質とエネルギーの流れが複数の領域を横断して循環する関係として捉えられている。たとえば、環境・社会・精神という三つの生態系をまたぐ動きに注目する見方が示されている。また、生態系は競争だけでなく協働によっても構成され、相利共生のような関係が地球の生物量の大部分を支えているとされる。植物の根と菌類、サンゴと細胞内藻類、被子植物と昆虫の送粉、動物と腸内微生物の関係は、その代表例である。
さらに、生態系という語は、AIスロップやディープフェイクポルノ、放射性や有害なレアアース採掘場のように、新たに現れる問題群を説明するためにも用いられる。こうした用法では、生態系は自然だけでなく、技術、社会、情報、資源採掘を含む広い相互依存の構造を示す概念として働く。